Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms