Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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