Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYRIPQ8NFW9 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYRIPQ8NFW9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms