Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms