Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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