Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ACTBP60709 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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