Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HADHBP55084 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HADHBP55084 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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