Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AP000346.1-201ENST00000390329 1087 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MIA-RAB4B-201ENST00000600729 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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