Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP2P32456 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms