Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms