Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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