Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIG1P18858 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIG1P18858 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIG1P18858 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIG1P18858 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms