Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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