Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms