Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PFDN4Q9NQP4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PFDN4Q9NQP4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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PFDN4Q9NQP4 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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