Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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