Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms