Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNPPD1Q9BV87 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms