Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms