Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms