Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms