Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms