Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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