Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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