Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NRF1Q16656 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms