Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SRSF5Q13243 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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