Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms