Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP46P62068 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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