Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL23P55773 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL23P55773 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL23P55773 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms