Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MMP13P45452 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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