Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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