Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms