Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SCN2BO60939 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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