Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms