Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms