Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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