Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms