Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BBS2Q9BXC9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms