Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RSPRY1Q96DX4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RSPRY1Q96DX4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms