Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms