Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms