Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 EPN2-AS1-201ENST00000451099 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LSP1P2-201ENST00000479042 133 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLA-206ENST00000517648 896 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AP000911.1-204ENST00000533091 571 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FAM19A2-214ENST00000551449 580 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PRSS58-202ENST00000552471 1123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01551-204ENST00000552957 734 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC087222.1-201ENST00000571113 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 APOC1P1-204ENST00000575148 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC005324.1-203ENST00000580194 541 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC011473.3-201ENST00000594910 485 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC005387.2-201ENST00000596596 440 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC010530.1-201ENST00000602844 569 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00539-204ENST00000608957 869 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00623-202ENST00000614062 830 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC125257.2-201ENST00000619176 156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL513327.1-208ENST00000624012 1047 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PASK-216ENST00000629419 216 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL031291.1-201ENST00000641979 742 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SERPINA12-202ENST00000556881 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PAX6-249ENST00000639034 1597 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL121900.1-201ENST00000428285 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TRAF3IP2-208ENST00000392556 2188 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC018737.2-201ENST00000624478 1512 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KDM4D-201ENST00000335080 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 C1orf94-201ENST00000373374 2136 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CELA1-201ENST00000293636 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GSTM1-202ENST00000349334 1028 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP180-201ENST00000363913 330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 USF1-201ENST00000368019 998 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ATP1A1-AS1-201ENST00000369491 773 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL031229.1-201ENST00000404273 224 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 REG3A-203ENST00000409839 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FAM238A-201ENST00000412114 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms