Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF5P-201ENST00000357046 1606 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ANKEF1-202ENST00000378392 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL353616.1-201ENST00000436315 2860 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IL36RN-201ENST00000346807 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN9-203ENST00000366666 2173 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZC4H2-202ENST00000374839 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAAH2-201ENST00000374900 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A6-202ENST00000395266 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms