Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CUL3Q13618 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CUL3Q13618 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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