Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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