Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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