Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms