Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMAN1P49257 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMAN1P49257 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms