Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms