Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP1P29466 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP1P29466 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP1P29466 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP1P29466 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP1P29466 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP1P29466 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP1P29466 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms